המערות בהן הוסתרו המגילות נמצאות ברובן מדרום לאתר קומראן, חפורות בסלע המצוק הרך מעל נחל קומראן. ההגעה אליהן מסוכנת, אולם ניתן להשקיף על חלקן משפת המצוק (זהירות!). הלאה משם ניתן לראות את כתם הירק של עינות צוקים, שם צמחו לפנים מטעי התמרים של בני קומראן. ניתן להשקיף על המערות גם מלמטה. יש לנסוע בכביש 90 כברת דרך קצרה ביותר דרומה מהאתר. דרך עפר, המתאימה לרכב פרטי, פונה לאורך ערוץ נחל קומראן וממשיכה עד תחתית המפל היבש (יש להימנע מנסיעה או הליכה בקטע זה בימי גשם בהם קיים חשש לשטפונות).
כתב: יותם יעקבסון